Su equipo filial es el Atlético Malagueño, fundado en 1990, camisetas futbol 2023 que actualmente milita en el grupo IX de la Tercera División. El Málaga Club de Fútbol actual se fundó como Club Atlético Malagueño el 25 de mayo de 1948 y se convirtió en sociedad anónima deportiva el 29 de junio de 1994 con el nombre de Málaga Club de Fútbol.