En la Copa de Italia, el equipo no pasó la primera fase, donde pudo enfrentar al Inter de Milán, real betis balompie tienda ante el cual perdió por la mínima. Entre marzo de 1989 y febrero de 1990, y luego de un largo torneo de 10 partidos en el que anotaron 33 goles; la Universidad obtuvo su tercer título de la zona en la Copa de Campeones de la Concacaf 1989, nuevamente de forma invicta, ya con la dirección técnica de Miguel Mejía Barón.
